Estudio de las relaciones suelo/vegetación/clima, de la dinámica de la materia orgánica del suelo y nutrientes desde el punto de vista de la calidad y fertilidad del suelo, del almacenamiento de carbono y de lucha contra el cambio climático. Desarrollo de estrategias para la conservación de los suelos forestales.

Estudio de la ecología fúngica. Comprensión la sucesión de comunidades fúngicas asociadas a la recuperación de la vegetación después de un incendio forestal, modelización de la producción y diversidad fúngica asociada a diferentes escenarios de manejo en ecosistemas, micología aplicada y conservación de flora en peligro de extinción.

Empleo de la teledetección espacial, la radiometría de campo y los SIG para el estudio de los sistemas forestales (análisis de incendios forestales, sanidad forestal, evolución temporal de carbono fijado o biomasa de sistemas forestales entre otros).

Manejo integrado de plagas y enfermedades forestales. Desarrollo de métodos, tácticas y estrategias acordes con los criterios de sostenibilidad, orientadas a la reducción de los perjuicios sobre el arbolado causados por agentes bióticos nativos e introducidos.

Esta línea está enfocada por un lado a desarrollar métodos y herramientas que minimicen la incidencia de los incendios forestales, facilitando su prevención y el control, mientras que también trata de avanzar en el conocimiento de los efectos del fuego sobre los elementos de estos ecosistemas y sus estrategias.

Desarrollo y evaluación de sistemas selvícolas adecuados a situaciones ambientales, económicas y sociales cambiantes. Desarrollo de técnicas de manejo adaptativo que faciliten generar nuevos sistemas selvícolas.

Desarrollo de modelos de dinámica forestal (crecimiento, producción, demografía y distribución) integrando información ambiental y selvícola para predecir la evolución de los sistemas forestales ante el cambio social y ambiental. Investigación sobre nuevos métodos de elaboración de modelos de dinámica forestal y su implementación en sistemas de apoyo a la toma de decisiones selvícolas.

Estudio de los cambios en la vegetación y el suelo durante la sucesión en ecosistemas degradados. Identificación de los mecanismos responsables y de factores bióticos y abióticos implicados en la regeneración forestal.

Estudios sobre dendrocronología, crecimiento de árboles, modelización y variabilidad del clima, ecología forestal, anatomía de la madera, conservación y gestión recursos naturales , fenología de árboles, ecología del paisaje y biogeografía entre otros.

Estudio de los factores y parámetros genéticos esenciales en la mejora y conservación de recursos genéticos forestales. Aplicación a programas de mejora y conservación de recursos genéticos y de los procesos ecológicos, poblacionales y factores evolutivos que determinan la dinámica de poblaciones forestales.

Estudios de diversidad microbiana asociada a decaimientos forestales (metabarcoding), análisis de datos de secuenciación masiva (HTS), análisis de expresión diferencial de genes (RNAseq), diseño de moléculas de RNA interferente (SIGS), descubrimiento de nuevos virus RNA en ecosistemas forestales (metaviromas).

Metodologías de gestión pastoral, y manejo de poblaciones de fauna silvestre bajo distintos escenarios de manejo.

Búsqueda de la mejora de la calidad ecológica de los ríos y conseguir hacer compatibles las actividades humanas con los ecosistemas acuáticos, asistencias científico-técnicas especializadas en el campo de los recursos hídricos, aprovechamientos piscícolas y sus ecosistemas asociados.

Promoción de la sostenibilidad de nuestros ecosistemas mediante el uso de las tecnologías de la información y las comunicaciones (TICs) y del análisis masivo de datos.

Estudios sobre investigación interdisciplinaria, utilizando métodos de investigación cualitativa y participativa y trabajando en psicología comunitaria y socioambiental y centrándose en la sostenibilidad social, el desarrollo rural, la silvicultura.